Couplage fonctionnel de la transcription et de la maturation des ARNs

Couplage fonctionnel de la transcription et de la maturation des ARNs

Nous souhaitons mieux comprendre comment les différentes étapes de maturation de l’ARN sont intimement couplées à la transcription par les ARN polymérases. Au cours des dernières années, nous avons découvert que la protéine Seb1 chez la levure à fission joue un rôle essentiel et conservé dans la sélection du site de polyadénylation des ARNs. Seb1 est recruté aux unités transcriptionnelles par le domaine C-terminale (CTD) de la plus grande sous-unité du complexe ARN polymérase II où Seb1 contribue positivement à la pause de la transcription, favorisant ainsi la sélection du site de polyadénylation.

Nous avons également utilisé l’édition du génome par CRISPR/Cas9 chez la levure pour introduire une substitution dans Rbp1 qui réduit le taux d’élongation de la transcription et montré que ces mutations dans la RNAPII provoquent des changements généralisés dans la sélection de sites de polyadénylation alternatifs.

Publications pertinentes:

Yague-Sanz, C., Y. Vanrobaeys, R. Fernandez, M. Duval, M. Larochelle, J. Beaudoin, J. Berro, S. Labbe, P. E. Jacques and F. Bachand (2020). « Nutrient-dependent control of RNA polymerase II elongation rate regulates specific gene expression programs by alternative polyadenylation. » Genes Dev 34: 883-897.

Larochelle, M., M. A. Robert, J. N. Hebert, X. Liu, D. Matteau, S. Rodrigue, B. Tian, P. E. Jacques and F. Bachand (2018). « Common mechanism of transcription termination at coding and noncoding RNA genes in fission yeast. » Nat Commun 9: 4364.

Lemay, J. F., S. Marguerat, M. Larochelle, X. Liu, R. van Nues, J. Hunyadkurti, M. Hoque, B. Tian, S. Granneman, J. Bahler and F. Bachand (2016). « The Nrd1-like protein Seb1 coordinates cotranscriptional 3′ end processing and polyadenylation site selection. » Genes Dev 30: 1558-1572.

PROGRAMME DE RECHERCHE

DÉTAILS SUR LES PROJETS

Régulation de l’expression des gènes par la polyadénylation

La dystrophie musculaire oculopharyngée (DMOP) est une maladie héréditaire causée par des mutations dans le gène codant pour PABPN1 (Poly(A)-Binding Protein Nuclear 1).

Fonctions spécialisées des protéines ribosomiques

La vision classique des protéines ribosomiques (PR) est l'une de protéines cellulaires génériques qui fonctionnent exclusivement pour maintenir l'intégrité du ribosome.

Couplage fonctionnel de la transcription et de la maturation des ARNs

Nous souhaitons mieux comprendre comment les différentes étapes de maturation de l'ARN sont intimement couplées à la transcription par les ARN polymérases.

Surveillance nucléaire des ARNs

Des études récentes indiquent que la transcription est omniprésente chez les eucaryotes, produisant un réseau complexe d'ARN non-codants qui existent de manière stable dans les cellules ou sont rapidement dégradés.